理化学研究所 計算科学研究機構

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到来する大規模生命情報の解析に備えて

計算生命科学の基礎Ⅱ 「到来する大規模生命情報の解析に備えて」 The Cancer Genome Atlas (TCGA) を始め、 ConnectivityMap, BioGPS など、公開されている大量の遺伝子発現データを閲覧、利用する方法を紹介する。また、1000サンプル以上の遺伝子発現プロファイルを扱った経験から、ヒートマップ、クラスタリング図など、基礎的なデータ表示の読み取り方および、データドリブンで構築される情報を解釈する際の問題点などを取り上げる。